本届香港区议会选举采用电子选民登记册派发选票，系统于昨晚7时许故障半小时，必须改用纸本选民登记册派票，选管会将投票时间延长一个半小时，之后选管会至今凌晨未再更新每小时投票数字。选管会主席陆启康强调额外延长投票时间一小时，是为确保所有想投票的市民都能公平投票，否认为推高投票率。

明报报导，特首李家超今凌晨见传媒表示高度关注系统故障，选管会会成立专责小组调查事件成因，将由选管会委员、资深大律师文本立领导，港府信息技术总监办公室、警察网络安全及科技罪案调查科、选举处相关部门会参与，将于3个月内于今届选举报告书就事件详细汇报。

据报导，电子选民登记册系统昨晚7时42分发生问题，选管会指系统后台数据库出现异常，影响所有票站，间歇性地未能比对数据，票站需暂停投票。选管会至晚上8时12分决定使用后备方案，全面采用纸本选民登记册派票。陆启康称，现阶段仍在调查事故原因，暂无证据显示系统受网络攻击。

报导称，翻查前年立法会选举，当时有个别投票站因为电力接驳或网络连接问题，影响电子选民登记册系统，当时暂停投票3至22分钟不等，选管会当届仅补回相应投票时间，没有额外延长投票时间。

报导说，港大社科院前院长卜约翰（John Burns）质疑，电子选民登记册仅故障约半小时，当局延长投票时间1.5小时决定武断，冀当局清楚解释背后逻辑。他指出，新制下市民对区选的信任程度本已较低，今次事件或影响选举认受性。

另据香港01报导，电子选民登记册昨晚有半小时无法使用，黄大仙凤德社区中心票站有选民表示，本想到票站投票后回家，怎料获悉暂时不能投票，大大降低投票意愿，冲完凉都准备睡觉不会想出门；亦有人批评当局好失败，浪费钱做宣传。

青衣明爱圣若瑟中学投票站的陈先生砲轰当局应变措施欠佳：大锣大鼓浪费这么多资源宣传，几年都不曾真正遇过这么大型投票，为何没有做好测试，从未见过安排这么差，好失败，只浪费钱做宣传，十几个职员不停打电话，都没有向市民讲解此事！马头涌官立小学投票站选民黄小姐批评：肯定要有plan B（后备方案）！有没有搞错呀！